Antes de importar os dados para a sua base MySQL, defina um collation padrão. No Brasil o Latin1 é o mais utilizado, então o CHARSET (codificação de caracteres) padrão na Locaweb é o Latin1 e o COLLATE (collation) padrão é o latin1_general_ci. Scripts externos podem utilizar UTF8 e geralmente é por causa da diferença de codificação entre Latin1 e UTF8 que ocorrem erros de acentuação.
A seguir estão alguns exemplos para definir um collation padrão para a sua base de dados:
ALTER DATABASE `sua_base` CHARSET = Latin1 COLLATE = latin1_swedish_ci;
ou
ALTER DATABASE `sua_base` CHARSET = UTF8 COLLATE = utf8_general_ci;
CHARSET e COLLATE são coisas distintas, no MySQL, cada CHARSET possui COLLATEs, cada um com sua particularidade. O intuito deste Wiki não é explicar as características de cada um deles, pois pode ser visto da documentação do MySQL, mas daremos um pequeno descritivo entre latin1_general_ci, latin1_general_cs e latin1_swedish_ci.
latin1_general_ci: Não há distinção entre letras maiúsculas e minúsculas. Buscando por ?teste?, registros como ?Teste? ou ?TESTE? serão retornados.
latin1_general_cs: Distingue letras maiúsculas e minúsculas. Buscando por ?teste? somente retornará ?teste?. Opções como ?Teste? e ?TESTE? não serão retornadas.
latin1_swedish_ci: Não distingue letras minúsculas e maiúsculas e nem caracteres acentuados e com cedilha, ou seja, o registro que contém a palavra ?Intuição? será retornado quando houver uma procura pela palavra ?intúicao?.
Quando você estiver exportando os dados da sua base de dados de origem, certifique-se de estar especificando a codificação corretamente. No phpMyAdmin há um menu DropDown próximo às opções de compactação ?nenhum?, ?zip?, ?gzip? e ?bzip? que normalmente está selecionada a opção ?utf-8?. Mantenha este se sua base estiver com este CHARSET, do contrário, especifique ?iso-8859-1? caso ela esteja com o CHARSET Latin1.Faça o mesmo durante a importação. Ao enviar o arquivo, o menu DropDown estará como ?utf-8?, se o CHARSET da base for ?Latin1? escolha o ?iso-8859-1?.